日本留学拿到在留资格认定证明书后，是否会被拒签并不能一概而论，具体结果取决于签证审查的结果。
在留资格认定证明书是日本法务大臣对外国人在日本进行活动（如留学、工作等）的认可证明，是申请日本签证的重要材料之一。但这并不意味着有了在留资格认定证明书就一定能够获得签证。签证是由日本驻外使领馆发放的，签证官会根据申请人的个人情况进行综合判断，包括但不限于申请人的经济状况、健康状况、学习计划等。如果签证官认为申请人的情况不符合签证发放的标准，就有可能拒签。
1.在留资格认定证明书只是签证申请的一部分，申请人在申请签证时还需提交其他材料，如护照、照片、学历证明、经济证明等。
2.申请人需要确保提交的所有材料真实有效，任何虚假信息都可能导致签证被拒。
3.签证官在审查签证申请时，也会考虑申请人所在国家的政治、经济状况等因素。
总的来说，虽然在留资格认定证明书是申请日本签证的重要材料，但签证的发放还需要考虑多种因素。因此，即使已经获得了在留资格认定证明书，申请人在申请签证时仍需谨慎对待，确保提交的所有材料真实有效，并符合签证发放的标准。
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