伊犁地区拥有以下湖泊，其中以赛里木湖最为著名：
赛里木湖
特点 ：新疆最大高山湖泊，湖水清澈湛蓝，四周雪山环绕，夏季草原与野花盛开，被誉为“大西洋最后一滴眼泪”。 - 活动 ：游泳、划船、摄影，可观赏冰蓝湖景与日出日落。
伊犁河
特点 ：位于伊犁北部，水质清澈，适合休闲娱乐。
胡杨泉湖
特点 ：以胡杨湿地景观为主，兼具湖泊与沙漠景观特色。
太师关湖
特点 ：较小规模湖泊，适合生态游与自然探索。
其他说明 ：
巴尔喀什湖虽为新疆著名湖泊，但位于伊犁河下游，实际归属博尔塔拉州，非伊犁地区。- 果子沟大桥、特克斯八卦城等为非湖泊类景点，已作排除。
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