苏州车牌号以“苏E”开头，主要依据以下原因：
行政区划代码规则
江苏省车牌号采用字母+汉字编码方式，字母代表地级行政区划代码。苏E是苏州市的代码，由1992年发布的江苏省行政区划代码确定。该代码根据各市成为省辖市的时间排序，苏州市于1962年设立为省辖市，因此对应字母E。
与省会南京的区分
南京作为江苏省会，车牌以“苏A”开头，是全省唯一以字母A开头的城市。苏州虽为经济第一大市，但行政级别和历史沿革导致其车牌代码排在南京之后。
其他城市编码参考
按照同一规则，无锡（苏B）、徐州（苏C）、常州（苏D）、南通（苏F）、连云港（苏G）、淮安（苏H）等城市依次排列，均基于成立时间或行政调整顺序。
总结 ：苏州车牌“苏E”是江苏省内行政区划代码的固有标识，与城市综合实力或行政地位无关，而是遵循1992年确立的省辖市排序规则。
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