内蒙古自治区有两所医科大学，分别是内蒙古医科大学和包头医学院。
内蒙古医科大学位于内蒙古自治区首府呼和浩特市，是自治区内唯一的一所以医学为主，工、理、文、管、法、教育、哲学、历史等多学科协调发展的全日制本科高等院校。学校始建于1956年，经过几十年的发展，已经成为一所有着较高教学、科研和医疗水平的高等医学院校。
包头医学院位于内蒙古自治区包头市，是一所以医学为主，工、理、文、管、法、教育等多学科协调发展的全日制本科高等院校。学校始建于1958年，经过几十年的发展，形成了以医学为主，多学科协调发展的办学格局。
1.内蒙古医科大学现有基础医学院、临床医学院、药学院、护理学院等16个学院（部），有直属附属医院4所，非直属附属医院22所，教学实习医院70所。
2.包头医学院设有临床医学院、护理学院、药学院、公共卫生学院等13个学院（部），有直属附属医院3所，非直属附属医院12所，教学实习医院40所。
3.两所医科大学都致力于培养具有创新精神和实践能力的高素质医学人才，为内蒙古自治区的医疗卫生事业做出了重要贡献。
总的来说，内蒙古自治区的医科大学虽然不多，但是都在医学教育和医疗卫生事业上有着显着的贡献。
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