祁同伟杀害陈海的核心原因是为掩盖其犯罪证据，保护自身及利益集团的利益。具体分析如下：
证据威胁
陈海作为山水集团会计，掌握了祁同伟涉及贪腐的关键证据（如秘密账本、与蔡成功的交易等）。祁同伟担心陈海将这些证据公之于众，导致其犯罪行为被揭露。
利益保护
祁同伟通过祁氏企业（山水集团）获取巨额利益，与高小琴存在不正当关系。陈海若继续调查，可能威胁到祁同伟的财产安全及政治地位，因此必须消除隐患。
精心策划的谋杀
祁同伟安排醉酒司机在陈海前往机场的途中制造车祸，将其撞成植物人。这一行为既隐蔽又直接，成功阻断了陈海与外界的联系，避免证据外泄。
对兄弟的冷酷
尽管陈海是祁同伟的师弟，但祁同伟因权力欲望和对自身形象的维护，选择对陈海下毒手。相比之下，他对侯亮平（同样为师弟）则因忌惮其反腐能力而保留，体现了其极端的自私性。
综上，祁同伟的杀机源于对权力的贪婪和对罪证灭口的紧迫感，其行为充分暴露了其“胜天半子”的虚伪本质。
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