林芝市海拔最低的县是墨脱县。
墨脱县位于西藏自治区东南部，是林芝市下辖的一个县。墨脱县的平均海拔约为1200米，是整个西藏自治区海拔最低的地区之一。由于其特殊的地理环境和气候条件，墨脱县拥有丰富的自然资源和生物多样性。这里森林密布，河流纵横，景色十分壮观。同时，墨脱县也是我国最后一个通公路的县，其交通状况在近年来得到了极大改善。
1.墨脱县的地理位置：墨脱县位于喜马拉雅山脉南侧，东邻波密县，西界米林市，南与印度接壤，北靠察隅县。整个县面积约为1.2万平方公里。
2.墨脱县的自然环境：墨脱县地处亚热带湿润气候区，年平均气温在16℃左右，年降水量丰富，气候湿润，四季常绿，被誉为"西藏的江南"。
3.墨脱县的历史文化：墨脱县有着丰富的历史文化，是藏族、门巴族、珞巴族等多个民族的聚居地，拥有独特的民族文化和历史传统。
总的来说，墨脱县作为林芝市海拔最低的县，不仅拥有独特的自然环境和丰富的自然资源，也承载着深厚的历史文化底蕴，是西藏自治区内一颗璀璨的明珠。
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