是的，高速超时ETC通道会自动扣超时费。
ETC（电子不停车收费系统）通道的设计初衷是为了提高高速公路的通行效率，减少车辆排队时间。在使用ETC通道时，系统通常会根据车辆通过的时间点自动计算费用。如果车辆在ETC通道中停留超过规定的免费时间限制，系统将会自动扣取超时费。
具体来说，中国的ETC通道通常对免费通行时间有明确的限制，比如在高速公路服务区等特定区域，车辆可以免费停车一定时间（例如30分钟或1小时）。如果车辆在免费时间结束后仍然停留在ETC通道内，系统会自动启动计费，并对超出的时间段进行收费。
超时费用的计算方式可能会因地区和高速公路的具体规定而有所不同。一般来说，超时费用会按照高速公路的收费标准来计算，可能采取固定费用或者按分钟计费的方式。例如，某些高速公路可能会对超过免费时间的每一分钟收取固定的费用。
需要注意的是，虽然ETC系统能够自动扣费，但司机在使用ETC通道时仍然需要遵守交通规则和高速公路的管理规定。如果司机在ETC通道中故意长时间停留，不仅会被扣取超时费，还可能面临其他违规行为的处罚。
1. 超时费的具体标准和计算方式，可以参考当地高速公路管理部门或ETC服务提供商发布的公告。
2. 部分地区为了鼓励快速通行，可能会对超时费进行一定的减免政策，司机可以关注相关信息。
3. 在使用ETC通道时，如果司机对超时费用有疑问，可以联系ETC服务热线或前往相关管理部门进行咨询和申诉。
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