在进行税率抵扣时，应根据不同类型的税款进行相应的计算。
对于材料税率13%和工程税率9%的情况，首先要明确的是，这两种税率分别对应的是不同的税种。一般来说，材料税率13%对应的是增值税，工程税率9%对应的是建筑服务的增值税。在实际操作中，可以采用以下方式进行抵扣：
1.增值税抵扣：对于企业购买的材料，如果已经支付了13%的增值税，那么在进行工程服务时，这部分税款可以作为进项税进行抵扣。如果企业的建筑服务的增值税税率为9%，那么在计算应纳税额时，可以将已经支付的13%的进项税进行抵扣。
2.建筑服务增值税抵扣：对于企业提供建筑服务取得的收入，需要按照9%的税率缴纳增值税。如果在这个过程中，企业购买了已经缴纳了13%增值税的材料，那么这部分税款也可以作为进项税进行抵扣。
需要注意的是，具体的抵扣方式和比例还需要根据税法和相关政策进行调整。
1.税率抵扣是增值税的一个重要特点，其目的是避免重复征税，降低企业的税收负担。
2.在进行税率抵扣时，需要有足够的进项税才能进行抵扣。如果进项税不足，那么就无法进行抵扣。
3.在实际操作中，还需要注意各种税收优惠政策，这些政策可能会对税率抵扣产生影响。
总的来说，对于材料税率13%和工程税率9%的情况，可以通过增值税和建筑服务增值税的抵扣方式来降低企业的税收负担。但是，具体的抵扣方式和比例还需要根据税法和相关政策进行调整。因此，企业在进行税率抵扣时，还需要咨询专业的税务顾问，以确保操作的合规性和有效性。
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