根据权威信息源综合分析，去日本机票最便宜的时间主要集中在淡季出行，具体可分为以下三个时段：
冬季淡季（1月下旬-3月中旬）
正月假期结束，樱花季未开始，机票和酒店价格较低。
适合体验温泉、滑雪等冬季活动，部分航班含税总价低至400多元。
黄金周后至梅雨季前（5月下旬-6月）
避开日本黄金周（4-5月）和梅雨季（6月中旬开始），游客减少，价格优惠20%-30%。
气候宜人，适合观光，航班选择以周二、周三为佳。
暑假后至红叶季前（9月中旬-10月中旬）
夏季假期结束，红叶季尚未全面展开，旅游成本较低。
气候温和，适合游览城市和自然景观，机票价格较旺季便宜20%-30%。
其他建议 ：
提前购票 ：淡季机票需提前45天以上预订，次卡（如长龙航空）可锁定6月底前往返日本、泰国等地的低价。
错峰出行 ：春节前后（1-2月）、国庆假期（10月）等时段虽为旺季，但节前5天或节后5天可能推出特价票。
选择上述时段出行，可有效降低机票成本，同时兼顾旅行体验。
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