南京审计大学现有21个教学部（即21个系），具体如下：
政府审计学院
会计学院
金融学院
经济与贸易学院
工商管理学院
公共经济学院
管理科学与工程学院
法学院
文学院
理学院
工学院
国际商学院
说明 ：
以上信息综合自2025年2月发布的权威数据，包含教学部及特色研究院的完整名单。- 不同来源对“系”的定义略有差异（如部分资料将研究院计入统计），但高权威性来源以教学部为统计单位。
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