根据现有信息，北京市内属于空军系统的院校主要有以下两所：
中国人民解放军空军指挥学院
位于北京西郊颐和园昆明湖畔，是空军最高学府，正军级建制。该学院成立于1958年，是军队2110工程重点建设院校，主要培养空军中高级指挥军官、参谋军官等，涵盖空中作战指挥、空中预警与指挥控制等专业。
中国人民解放军陆军航空兵学院
位于北京市通州区，副军级建制，隶属于陆军。该学院是培养陆军航空兵中级政治指挥人才、直升机飞行员及航空工程机务干部的军事院校，实行军事与政治、指挥与技术等全学科学院制。
补充说明
其他提及的“空军工程大学”实际位于陕西省西安市，不属于北京；
空军预警学院、空军军医大学等也非北京院校，需根据具体招生简章确认。建议考生根据专业方向和职业规划，结合各院校招生简章及条件进行选择。
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