日本高中课程体系以学科和科目两个维度构成，具体设置如下：
共通科目 （必修）
所有学生必须学习的基础科目，包括：
国语（含国语综合、国语表现等8个子科目）
地理历史（含世界史、日本史等）
公民（含公共、伦理、政治·经济等）
数学（含数学1-3、数学A、B、C等）
理科（含物理基础、化学基础、生物基础等）
外语（含英语基础、交流英语等）
保健体育、艺术（音乐、美术、工艺等）
学科内细分科目
以国语学科为例，包含国语Ⅰ至Ⅱ、国语表达、现代文、古典文等8个子科目。理科包含物理、化学、生物等基础科目及地学基础。
必修科目 （基础能力培养）
高一：共通科目及部分选修科目（如数学I、生物基础等）
高二：分科后必修科目（如数学2、物理基础等）
高三：根据大学方向选择必修科目（如文科需社会研究、理科需数学B等）
选择必修科目
学生需从理科Ⅰ或理科Ⅱ中选择1-2小科，或组合学习。
选修科目
文科方向：国语、外语、社会、艺术、家政等
理科方向：物理、化学、生物、地学、计算机科学等
职业方向：技术、农业、护理等特色课程
分科机制
通常在二年级开始分科，分为文科、理科及职业方向课程。普通高中约占44%，综合高中36%，职业高中22%。2. 教材与考试
学科内教材不统一，学校自主性较大。普通高中以升学为导向，选修科目与大学专业关联。3. 综合素质教育
包含体育、艺术、家庭课程等，注重德智体美劳全面发展。
课程设置与大学升学紧密相关，例如重点大学需侧重数学、科学等科目。普通科课程泛用性较强，综合高中则提供职业导向课程。
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