南京农业大学的农业类专业设置较为全面，涵盖多个学科领域，具体包括以下主要方向：
农学
基础学科，包含作物学、遗传学、作物栽培学与耕作学等方向。
园艺学
研究园艺植物的栽培、繁育及园林景观设计。
植物保护
涵盖植物病虫害防治、检疫及生理生化研究。
种子科学与工程
专注于种子资源开发、遗传改良及应用技术。
农业资源与环境
研究土壤学、水资源管理及农业生态学。
环境科学与工程
侧重环境监测、污染控制及生态修复技术。
景观园林
培养风景园林规划、设计与保护人才。
生物技术
包括基因工程、发酵工程及生物信息学应用。
农业机械与装备
研究智能化农业装备设计、农业电气化及自动化技术。
农业资源利用
涉及生物质能、农业废弃物资源化利用等方向。
茶学 ：研究茶叶种植、加工及品质控制。
草业科学 ：专注于草本植物资源开发与利用。
农业经济管理 ：结合农业产业政策与经济管理理论。
南京农业大学在农业科学、植物与动物科学、环境生态学等12个学科领域进入ESI全球前1%，其中农业科学、植物与动物科学为A+学科。农学、植物保护、环境科学与工程等专业为省级重点建设专业。
以上专业设置综合了南京农业大学的学科评估结果和招生专业目录，具体以学校最新公布为准。
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