根据权威信息，合肥的二本大学主要包括以下学校（按类别整理）：
一、综合类二本大学
安徽农业大学
以农业为特色，涵盖农学、理学、工学、管理学等多学科，注重实践与科研创新。
安徽医科大学
省属重点大学，医学优势显着，拥有完善的医学教育体系和临床实践基地。
安徽建筑大学
以建筑、土木工程等领域为核心，是安徽省重点建设高校之一。
二、师范类二本大学
合肥师范学院 ：师范教育特色突出，工程领域表现优异。
三、其他二本大学
安徽中医药大学 ：中医药学科优势明显。
巢湖学院、合肥学院 ：公办本科高校，涵盖多学科领域。
说明 ：
以上信息综合自高权威性来源，包含综合类、师范类及特色学科院校。- 部分学校（如安徽外国语学院、安徽三联学院）未在权威名单中明确提及，建议以教育部门最新公布信息为准。
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