嘉兴市秀水中等专业学校目前设有8个专业系部，涵盖34个专业，具体如下：
机电系
包含数控技术应用、机电一体化（含制冷技术）等专业，其中数控技术应用为省级示范专业。
信息系
涵盖计算机应用、电子技术应用、商务英语等方向，注重信息化技能培养。
经贸系
设有会计、电子商务、餐饮管理与服务等专业，强调实践与理论结合。
财会系
包括会计、审计实务等课程，配备校企合作的新月会计学院，获国家级奖项13枚。
艺术系
开设动漫游戏、建筑装饰、服装设计与工艺等设计类方向。
人文系
涉及旅游服务与管理、幼师等社会服务类专业。
国际教育系
以商务日语、商务韩语、美容美体等为特色，培养涉外事务专业人才。
高职考部
聚焦中高职融通、单考单招等升学方向，涵盖数控技术应用、动漫画制作设计等专业。
补充说明
学校拥有国家级数控实训基地、省级动漫实训基地等硬件设施，支持30多个特色专业发展。- 专业设置注重产教融合，如会计专业与新月会计学院合作，强化实践教学。- 学校创建于1984年，是省级重点中专，学生规模6500余人。
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