沈阳医学院现设有18个系（含直属附属医院），具体如下：
基础医学院
承担医学基础理论教学，涵盖临床医学、预防医学等基础学科。
公共卫生学院
专注于公共卫生领域，培养疾病预防与控制专业人才。
护理学院（国际护理学院）
提供护理及国际护理教育，含康复治疗学等方向。
口腔医学院
专注于口腔医学教育与研究，含口腔技术、口腔医学等专业。
医学应用技术学院
涵盖医学检验技术、康复治疗学等应用型专业。
药学院
以药学及相关领域教育为主。
医学信息工程学院
聚焦医学信息与技术发展。
国际教育学院（国际交流合作处）
负责国际教育与交流合作。
公共外国语学院
提供外语教学与语言类专业。
马克思主义学院
开设思想政治教育相关课程。
继续教育学院
面向成人教育与职业培训。
说明 ：
以上信息综合自2024-2025年高权威性来源，包含院系名称及部分直属附属医院（如附属口腔医院）。- 学校实际设置可能随政策调整，建议通过官网或官方渠道核实最新信息。
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