截至2025年，粤港澳大湾区的高等教育机构数量包括多所公办、民办以及合作办学的高校。具体数量如下：
中山大学
华南理工大学
暨南大学
华南农业大学
南方科技大学
华南师范大学
南方医科大学
深圳大学
广东工业大学
广州大学
广州医科大学
广东外语外贸大学
广州中医药大学
东莞理工学院
广东财经大学
广州美术学院
广东技术师范大学
佛山科学技术学院
惠州学院
五邑大学
星海音乐学院
广东金融学院
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