连云港港口体系以连云港港为核心，涵盖多个港区及在建项目，具体如下：
连云港港
中国首批沿海开放城市核心港区，国家一级港口，新亚欧大陆桥东桥头堡，拥有88个万吨级及以上泊位，2021年3月被列为全国沿海27个主要港口之一。
灌南港
位于灌南县堆沟镇，是连云港市重点建设港口，承担长江三角洲北部地区的货物集散功能。
燕尾港
位于灌云县燕尾镇，处于连云港港北翼，是正在兴建中的现代化港口，未来将与连云港港形成协同发展。
柘汪港
位于赣榆区柘汪镇，是新建的综合性港口，与燕尾港共同构成“一体两翼”港口布局。
连云港新东方国际货柜码头 ：主要承担集装箱运输业务。
连云港庙岭港区 ：包含散货、集装箱等多功能泊位。
灌河港、五里墩渡口等 ：传统港口及过境节点，承担部分货运功能。
连云港古称海州，历史上曾有龙苴港、青口港等天然海湾，但因河口变迁逐渐衰落。目前，港口群已形成以连云港港为主，灌南、燕尾、柘汪为翼的现代布局。
连云港港口群以连云港港为核心，通过基础设施建设和产业升级，形成“一体厂内翼、两翼外延”的发展模式，致力于成为国际枢纽海港。
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