南京市拥有多所研究生院校，涵盖多个学科领域，以下为综合整理：
南京大学
中国最早开展研究生教育的高校之一，拥有文、理、工、医等多学科优势，2025年入选“双一流”建设高校。
东南大学
前身为1902年创立的三江师范学堂，是中央部属副部级重点大学，工科实力突出，2025年同样入选“双一流”。
南京航空航天大学
以航空航天为特色，2025年进入ABC中国大学排名第38位，是“211”“985”工程高校。
南京理工大学
工科强校，拥有国家级一流本科专业38个，博士点20个，硕士点35个，2024年软科排名第33位。
河海大学 ：水产学、环境科学与工程等学科优势显着。
南京农业大学 ：农业科学、生命科学领域突出，拥有90个硕士学位授权点。
南京师范大学 ：教育学、文学等学科较强，2011年成立研究生院。
南京医科大学 ：医学领域权威，博士点覆盖临床医学、基础医学等方向。
南京财经大学 ：财经类学科优势，拥有硕士点19个。
南京邮电大学 ：信息与通信领域领先，2025年入选“双一流”。
南京审计大学 ：财经与审计学科特色鲜明。
南京林业大学 ：林学、生态学为优势，拥有90+个学位授权点。
南京研究生院校覆盖哲学、法学、经济学、理学、工学、农学、管理学等9个学科门类，其中南京大学、东南大学、南京理工大学等在多个学科领域进入全国顶尖水平。
以上信息综合自多所高校官网及权威教育平台数据，排名不分先后且动态更新中。
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