法医学作为医学与法学交叉的学科，其系别设置因院校不同存在差异，但通常包含以下几个核心系别：
法医病理学系
研究死因、疾病与损伤之间的关系，通过尸体解剖和病理分析明确死亡原因及病理机制。
法医临床学系
聚焦临床医疗中的法医学问题，如医疗纠纷鉴定、手术痕迹分析等，强调临床思维与法医学的结合。
法医生物痕迹学系
专注于生物样本（如指纹、DNA、血迹等）的采集、分析和比对，是犯罪现场证据鉴定的关键环节。
法医证据科学系
研究证据的收集、保存、鉴定及法律程序中的证据应用，确保证据链的完整性和合法性。
法医毒物学系
专注于毒物检测与分析，包括中毒机制、毒物代谢及现场毒物残留鉴定。
法医毒理与毒物分析系
结合毒理学与毒物分析技术，研究毒物对机体的作用及检测方法。
部分院校可能设有：
法医物证系 ：专注于物证（如工具痕迹、弹道分析等）的专项研究；
法医精神病学系 ：研究精神疾病与犯罪行为的关联性。
法医学专业通常依托医学部或法学院设置，如南方医科大学设有5个学系并配备多个国家级平台，而其他院校可能根据特色调整专业方向。此外，法医学与刑事科学技术、司法鉴定等领域的交叉融合日益增强，部分院校还设有专门的鉴定中心或研究所。
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