食品系的专业设置因高校学科方向不同存在差异，但核心专业主要包括以下五类：
食品科学与工程
作为食品系的核心专业，涵盖食品加工、贮藏、质检等，培养研发、生产及管理能力。部分高校还设有中外合作办学方向。
食品质量与安全
专注于食品检测、标准制定及生产过程安全管理，毕业生可从事质检员、食品安全监督等工作。
食品营养与卫生
研究食品营养、健康效益及卫生管理，涉及功能性食品开发、营养配餐等，适合从事营养咨询或餐饮管理。
食品加工技术
培养食品加工操作技能，包括肉制品、乳制品、软饮料等工艺，毕业生多进入食品企业从事生产或质检。
食品生物技术
利用生物技术改进食品加工、保鲜及质量检测，涉及发酵工程、微生物应用等，适合科研或技术管理岗位。
其他关联专业 ：部分高校可能开设食品贮运与营销、食品机械与设备、酿酒技术等方向，侧重物流管理、机械设计或酒类生产。
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