物质的基本构成单位可以从微观角度归纳如下：
原子
所有物质都是由原子构成的。原子由原子核（含质子和中子）和绕核运动的电子组成。例如，金属单质（如铁、铜）直接由金属原子构成，稀有气体（如氦、氖）由稀有气体原子直接构成。
分子
分子由原子通过共价键结合形成，保持物质的化学性质。常见分子包括水（H₂O）、氧气（O₂）、二氧化碳（CO₂）等。分子是构成气体、液体和部分固体（如冰）的基本单位。
离子
离子是原子通过离子键结合形成的带电粒子，例如钠离子（Na⁺）和氯离子（Cl⁻）。离子化合物（如氯化钠NaCl）由阴阳离子直接构成。
基本粒子的层次关系 ：夸克是构成质子和中子等强子的基本单元，而质子和中子又构成原子核。但这一层次属于原子内部结构，不直接参与物质的三维构成。
物质构成的统一性 ：虽然分子、原子、离子是常见的构成方式，但归根结底，所有物质都是由原子通过不同方式组合而成的。
物理书表述差异 ：物理书可能简化为“物质由分子构成”，这是在宏观物质状态下的简化说法。化学上更准确的表述应为“物质由分子、原子、离子构成”。
稀有气体的特殊性 ：稀有气体为单原子分子，但整体仍视为原子直接构成物质。
综上，物质的基本构成单位为原子，而原子通过共价键形成分子，离子化合物则由离子直接构成。
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