商丘市共有7所高校，其中3所本科院校和4所专科院校。以下是具体名单及分类：
商丘师范学院
公办本科，河南省属重点高校，师范类专业突出，入选“百校工程”等国家级项目。
商丘工学院
民办本科，以工学为主，机械工程、电子信息工程等专业实力强，2011年转设为本科高校。
商丘学院
民办本科，2011年由河南农业大学华豫学院转设，应用科技学院已招生多年，综合排名全省前列。
商丘职业技术学院
全国示范性高职院校，专科教育顶尖，2025年校友会排名全国第四。
商丘医学高等专科学校
公办专科，医学类专业优势显着，毕业生供不应求。
商丘幼儿师范高等专科学校
公办专科，学前教育领域特色鲜明。
永城职业学院
公办专科，河南省骨干高职院校，职业教育质量突出。
公办与民办高校均包含，本科院校中商丘师范学院为唯一公办高校，其余为民办。
部分院校（如商丘工学院）存在一本/二本招生批次差异，但均属本科层次。
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