公司员工应缴纳的税费主要包括以下几类，具体如下：
工资薪金所得
包括基本工资、奖金、津贴（如交通补贴、餐补）、加班费、年终奖等，需扣除起征点5000元后按超额累进税率缴纳。
其他收入
劳务报酬、稿酬、利息、股息、红利等均需纳税。
五险一金
包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险及住房公积金，由单位代扣代缴。
附加税费
增值税 ：一般纳税人按销售额的13%-3%税率缴纳；
附加税 ：包括城建税（7%-1%）、教育费附加（3%）、地方教育附加（1%）及印花税等。
个人所得税专项附加扣除
包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等，可在计算应纳税所得额时扣除。
企业所得税
公司需为自身盈利缴纳，税率为25%，但员工个人不直接承担。
个人所得税代扣代缴
单位需为员工代扣工资中的个税及社保，发放时直接从应发工资中扣除。
营销奖励 ：以旅游、实物等形式发放的业绩奖励，需视同工资薪金或劳务报酬纳税；
股东红利 ：需缴纳20%个人所得税。
以上税费均需依法申报并履行纳税义务，员工可通过工资条或税务部门查询具体扣缴金额。
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