杜邦分析法作为经典的财务分析工具，虽然通过分解指标体系帮助理解企业财务表现，但也存在以下主要缺点：
过度关注短期财务结果
杜邦分析法通过分解净资产收益率（ROE）为营业净利率、总资产周转率和权益乘数三个指标，但各指标计算均基于历史财务数据，可能强化管理层对短期业绩的追求，而忽视长期价值创造。
依赖财务报表的准确性和时效性
该分析完全基于财务报表数据，若数据存在错误、操纵或滞后，分析结果将失去可靠性。此外，静态分析特性使其无法预测未来经营趋势。
无法衡量非财务因素
杜邦分析法仅关注财务指标（如利润率、资产周转率），无法直接反映市场环境、管理团队、技术创新等非财务因素对企业绩效的影响。
忽略资本结构优化
传统杜邦分析未区分金融负债与经营负债，未考虑资本结构变化对财务杠杆的影响，可能导致误导性结论。
工业时代与信息时代的局限性
该模型设计基于工业时代以财务指标为核心的企业评价体系，而在信息时代，顾客满意度、供应链管理、员工绩效等非财务因素的重要性显着提升，杜邦分析法已无法全面适应。
静态与动态分析的矛盾
杜邦分析为静态分析工具，无法动态追踪企业运营变化，需结合其他分析方法（如趋势分析、情景模拟）使用。
未考虑风险因素 ：仅聚焦财务绩效，忽略市场风险、运营风险等对企业的影响。
计算口径问题 ：传统公式中“总资产”与“净利润”不匹配（总资产为所有利益相关者所有，净利润仅属于股东）。
为克服上述局限性，可结合其他分析工具（如平衡计分卡、现金流分析）并纳入非财务指标（如市场份额、客户满意度），同时关注动态变化与风险因素，以形成更全面的财务评估体系。
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