截至2024年9月，河海大学共有 31个院系 ，具体设置如下：
传统优势学院
水文水资源学院、水利水电学院、港口海岸与近海工程学院、土木与交通学院、环境学院、能源与电气学院、计算机与信息学院、机电工程学院、力学与材料学院、地球科学与工程学院、农业科学与工程学院、海洋学院、理学院、商学院、公共管理学院、法学院、马克思主义学院、外国语学院、体育系等。
特色学院与交叉学科
包括港口海岸与近海工程学院、水利水电学院、环境学院、土木与交通学院、能源与电气学院、计算机与信息学院、机电工程学院、力学与材料学院、地球科学与工程学院、农业科学与工程学院、海洋学院、理学院、商学院、公共管理学院、法学院、马克思主义学院、外国语学院、体育系、大禹学院（拔尖人才培养学院）、国际教育学院、远程与继续教育学院等。
其他说明
学院数量可能因学科发展调整，建议以官网最新信息为准。
温馨提示：
