根据权威信息综合分析，福建省内综合实力最强的学校为 厦门大学 ，其次是 福州大学 和 福建师范大学 。以下是具体分析：
厦门大学
985/211/双一流 ：教育部直属副部级综合性研究型全国重点大学，学科覆盖12大门类，海洋科学、经济学等学科实力突出。
科研与国际化 ：拥有300多个研究机构、6个国家重点实验室，海外设有马来西亚分校，科研水平全国领先。
就业前景 ：毕业生就业率高，保研名额多，易进入大企业或五百强企业。
福州大学
211/双一流 ：以工科见长，机械、电子、化工等专业实力强劲，入选“世界一流学科建设高校”。
学科优势 ：多学科协调发展，综合排名在省内稳居前列。
福建师范大学
师范类顶尖 ：福建省重点建设高校，学科种类齐全，师范类专业优势显着，为国家和地方教育事业输送大量人才。
华侨大学 ：中央统战部直属，经济、管理、法学等学科表现突出，国际化程度高。
福建农林大学 ：农林学科优势明显，农业农村部、国家林草局共建，多学科协调发展。
优先考虑厦门大学 ，其综合实力和就业前景最突出。
理工科选福州大学 ，师范类选福建师范大学，特色专业更精准。
温馨提示：
