根据搜索结果，科目二在南平的报名费因报名方式不同存在差异，具体如下：
驾校报名
一般驾校收取的科目二报名费为 1000元 ，包含在总培训费用中（如4000元套餐）。
自行报名
若直接到南平市驾考中心报名，科目二报名费为 1000元 ，需额外支付场地费200元。
总结 ：科目二报名费在南平统一为 1000元 ，但需注意不同机构是否包含此项费用。建议优先选择正规驾校并提前确认费用明细。
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